西元2199年，太阳系外的黑暗势力——加米拉斯帝国挥舞着铁拳，肆意侵略星际万象。母星地球沦为其血盆大口下的猎物，遭受惨无人道的屠杀和辐射冲击。地球军曾奋勇抵抗，但阵亡和伤病者越来越多，抵抗力量渐趋疲软。此时，另一颗双子星球伊斯坎达尔却伸出了援手，赠送地球军波动引擎和波动炮的设计图纸。更为珍贵的是，他们向地球介绍了自家研制的超级装置——宇宙清洗器D，这个神奇的宇宙武器可以清除所有辐射能量。在全球失联的恐惧和沮丧下，地球军重燃了生存的希望。他们改装了被遗忘深海的大和号，将其变身为拯救地球的宇宙战舰。全体乘员不顾生死，抱着泰山重托的使命，踏上了漫漫征程，在险象环生的星空中穿梭，为地球的未来而战！g